АНАЛІЗ ПОВЕРХОНЬ ХІРШФЕЛЬДА КРИСТАЛІВ КОМПЛЕКСІВ – ПРОДУКТІВ ВЗАЄМОДІЇ В СИСТЕМАХ МХ2–1,10-ФЕНАНТРОЛІН – GeO2 – ЛИМОННА КИСЛОТА (М = Ni, Co; X = Cl, CH3COO)

Автор(и)

  • О. В. Бучко Одеський національний університет імені І. І. Мечникова, Ukraine

DOI:

https://doi.org/10.18524/2304-0947.2021.2(78).235506

Анотація

Методом поверхонь Хіршфельда охарактеризовано міжмолекулярні взаємодії у координаційних сполуках катіон-аніонного типу [Ni(phen)3][Ge(HCit)2]·2H2O (I), [Co(phen)3][Ge(HCit)2]⋅2H2O (II), [Co(H2O)2(phen)2]2[Ge(Cit)2]·4H2O (III). Встановлено, що найбільший вклад у поверхні Хіршфельда аніонів вносять водневі зв’язки H…О/О…Н, а взаємодії C…H/Н…С є менш значними. При аналізі відсоткового внеску різних контактів катіонів в кристалах показано, що домінуючими є зв’язки H…Н та C…H/Н…С, а вклад взаємодій H…О/О…Н та С…С є значно меншим. На підставі розрахунку об’єму та площі поверхні порожнин у кристалах I–III виявлено, що великих порожнин у каркасах досліджених сполук немає.

 

Посилання

Prokaeva M.A., Baburin I. A., Serezhkin V. N. On methods to determine the surface areas of molecules. J. Struct Chem., 2009, vol. 50, no 5, pp. 867–872. https://doi.org/10.1007/s10947–009–0129–5

Ruiz A., Perez H., Morera-Boado C., Almagro L., da Silva C. C.P., Ellena J., de la Vega J. M.G., Martínez-Álvarez R., Suárez M., Martín N. Unusual hydrogen bond patterns contributing to supramolecular assembly: conformational study, Hirshfeld surface analysis and density functional calculations of a new steroid derivative. Cryst. Eng. Comm., 2014, vol. 16, no 33, pp. 7802–7814. https://doi.org/10.1039/C4CE00709C

Seyfi S., Alizadeh R., Ganji Masoud D., Amani V. Polymorphism of Palladium(II) complexes: crystal structure determination, luminescence properties, Hirshfeld surface analyses and DFT/TD-DFT studies. ChemistrySelect., 2019, vol. 4, no 20, pp. 6209–6218. https://doi.org/10.1002/slct.201900804

Ivachtchenko A.V., Mitkin O. D., Kravchenko D. V., Kovalenko S. M., Shishkina S. V. et al. Synthesis, X‑ray crystal structure, Hirshfeld surface analysis, and molecular docking study of novel inhibitor of hepatitis B: methyl 4-fluoro‑3-(morpholinosulfonyl)benzo[b]thiophene‑2-carboxylate. Heliyon., 2019, vol. 5, no 11, pp.e02738. https://doi.org/10.1016/j.heliyon.2019.e02738

Praveen S., Ranjeet K., Ashish K. T. Hydrogen bonding framework in imidazole derivatives: Crystal structure and Hirshfeld surface analysis. Eur. J. Chem., 2020, vol. 11, no 1, pp. 50–59. https://doi.org/10.5155/eurjchem.11.1.50–59.1945

Padma D., Gauri D. B., Puneet S. Trans А2В2 Porphyrins: Synthesis, crystal structure determinations and Hirshfeld surface analysis. ChemistrySelect., 2020, vol. 5, no 24, pp. 7298–7309. https://doi.org/10.1002/slct.202001052

Tojiboev А., Zhurakulov S., Englert U., Wang R. et al. Hirshfeld Surface Analysis and Energy Framework for Crystals of Quinazoline Methylidene Bridged Compounds. Proc., 2020, vol. 62, no 1, pp. 1–9. https://doi.org/10.3390/proceedings2020062001

Seifullina I.I., Martsinko E. E., Chebanenko E. A., Pirozhok O. V., Shishkina S. V., D’yakonenko V. V. Structure of bis(citrato)germanates with different types of cations: (Hphen)2[Ge(HCit)2⋅3H2O],[CuCl(phen)2]2[Ge(HCit)2⋅6H2O], where H4 Cit is citric acid, phen is 1,10-phenanthroline. J. Struct. Chem.,2017, vol. 58, no 3, pp. 532–538. https://doi.org/10.1134/S0022476617030143

Martsinko E., Seifullina I., Chebanenko E., Pirozhok O., Dyakonenko V., Shishkina S. Synthesis and crystal structure of bis(citrato)germanate and stannate with tris(phenanthroline)nickel(II) cation. Chem. J. Moldova., 2018, vol. 13, no 2, pp. 56–62. http://dx.doi.org/10.19261/cjm.2018.513

Seifullina I.I., Martsinko E. E., Chebanenko E. A., Pirozhok O. V., Dyakonenko V. V., Shishkina S. V. Synthesis, thermal stability, and structure of dis(citrato)germanates: [Co(Phen)3][Ge(HCit)2]·2H2O, [Fe(Phen)3] [Ge(HCit)2]·4H2O (H4Cit = citric acid, phen = 1,10-phenanthroline). Rus. J. Coord. Chem., 2017, vol. 43, no 8, pp. 505–511. https://doi.org/10.1134/S1070328417080061

Martsinko E. E., Chebanenko E. A., Pirozhok O. V., Seifullina I. I., Dyakonenko V. V., Shishkina S. V. Modification of bis(citrato)germanates with hexaaquacations of cobalt(II) and manganese(II) by 1,10-phenanthroline. Voprosy khimii i khimicheskoi tekhnologii, 2018, no 6(121), pp. 49–55. https://doi.org/10.32434/0321–4095–2018–121–6–49–55 (in Russian)

Martsinko Е., Buchko О., Chebanenko Е., Seifullina I., Dyakonenko V., Shishkina S. Different structural types of hetero-metal bis(citrato)germanates with 1,10-phenanthroline: Targeted synthesis, spectral, thermal properties and Hirshfeld surface. Journal of Molecular Structure, 2021, vol. 1237, pp. 1–8. https://doi.org/10.1016/j.molstruc.2021.130297

Chebanenko E. A., Buchko O. V., Afanasenko E. V., Seifullina I. I., Martsinko E. E. Hydrogen bonds in the formation of copper(II) 1,10-phenanthroline hydroxycarboxylatogermanate crystals using hirshfeld surface analysis. Vіsn. Odes. nac. unіv., Hіm., 2021, vol. 26, no 5, pp. 85–96. https://doi.org/10.18524/2304–0947.2021.1(77).226142 (in Ukranian)

Spackman P.R., Turner M. J., McKinnon J.J., Wolff S. K., Grimwood D. J., Jayatilaka D.,

Spackman M. A. CrystalExplorer: a program for Hirshfeld surface analysis, visualization and quantitative analysis of molecular crystals. J. Appl. Cryst., 2021, vol. 54, no 3, pp. 1006–1011. https://doi.org/10.1107/S1600576721002910

##submission.downloads##

Опубліковано

2021-07-31

Номер

Розділ

Статті