ВИЗНАЧЕННЯ РОЛІ ВОДНЕВИХ ЗВ’ЯЗКІВ У ФОРМУВАННІ КРИСТАЛІВ КУПРУМ (II) 1,10-ФЕНАНТРОЛІН ГІДРОКСИКАРБОКСИЛАТОГЕРМАНАТІВ МЕТОДОМ ПОВЕРХОНЬ ХІРШФЕЛЬДА

Автор(и)

  • О.А. Чебаненко Одеський національный університет ім. І. І. Мечникова
  • О.В. Бучко Одеський національный університет ім. І. І. Мечникова
  • Е.В. Афанасенко Одеський національный університет ім. І. І. Мечникова
  • І.Й. Сейфулліна Одеський національный університет ім. І. І. Мечникова
  • О.Е. Марцинко Одеський національный університет ім. І. І. Мечникова

DOI:

https://doi.org/10.18524/2304-0947.2021.1%20(77).226142

Анотація

Представлена робота присвячена дослідженню міжмолекулярних взаємодій комплексних сполук катіон-аніонного типу [Cu(Phen)2Cl]2[Ge(HCit)2]⋅6H2O (I), [Cu(Phen)3]2[Ge2(OH)(HTart)(μ-Tart)2]·11H2O (II), [CuCl(Phen)2]4[{Ge2(OH)2(μ-Tart)2}Cl2]·4Н2О (III), [Cu(Phen)3]2[(OH)2Ge2(μ-HXylar)4Ge2(μ-OH)2]·8H2O (IV), [CuCl(Phen)2]4[(OH)2Ge2(μ-HXylar)4Ge2(μ-OH)2]·8H2O (V) методом поверхонь Хіршфельда. Встановлено, що в складі сполук спостерігаються різні типи водневих взаємодій: біфуркатні, симетричні О-Н…О, С-Н…С та несиметричні за участю молекул води. Двовимірні гістограми, 2D-розгортки поверхонь Хіршфельда дозволили кількісно оцінити зв’язки в кристалах, та встановити, що найбільший внесок в загальну площу поверхонь гідроксикарбоксилатогерманатних аніонів сполук IV вносять зв’язки H…O/O…H та контакти H…H. Визначальним для формування кристалів виявилась присутність великої кількості молекул кристалізаційної води, що приймають участь в утворенні складної системи водневих зв’язків та зміцнюють структуру, яка в іншому випадку була б нестійкою через великі розміри катіонів та аніонів.

Посилання

Sandip B., Anunay S. Long and Short Brick Network Architecture: Role of Water Molecules Acting as Three-Connecting Spacers. Cryst. Growth Des., 2006, vol. 6, N5, pp. 360–362. https://doi.org/10.1021/cg050517s

Vologzhanina A.V., Kats S. V., Penkova L. V., Pavlenko V. A., Efimov N. N., Minin V. V., Eremenko I. L., Combined analysis of chemical bonding in a Cu dimer using QTAIM, Voronoi tessellation and Hirshfeld surface approaches. Acta Cryst., 2015, Vol. B71, N5, pp. 543–554. https://doi.org/10.1107/S2052520615015279

Spackman M.A., McKinnon J. J. Fingerprinting intermolecular interactions in molecular crystals. Cryst. Eng.Comm., 2002, vol. 4, no 66, pp. 378–392. https://doi.org/10.1039/b203191b

Parkin A., Barr G., Dong W., Gilmore C. J., Jayatilaka D., McKinnon J.J., Spackman M. A., Wilson C. C. Comparing entire crystal structures: structural genetic fingerprinting. Cryst. Eng. Comm., 2007, vol. 9, no 7, pp. 648–652. https://doi.org/10.1039/b704177b

Clausen H.F., Chevallier M. S., Spackman M. A., Iversen B. B. Three new co-crystals of hydroquinone: crystal structures and Hirshfeld surface analysis of intermolecular interactions. New J. Chem., 2010, vol. 34, no 2,pp. 193–199. https://doi.org/10.1039/b9nj00463g

Praveen S., Ranjeet K., Ashish K. T. Hydrogen bonding framework in imidazole derivatives: Crystal structure and Hirshfeld surface analysis. Eur. J. Chem., 2020, vol. 1, no 1, pp. 50–59. https://doi.org/10.5155/eurjchem.11.1.50–59.1945

Padma D., Gauri D. B., Puneet S. Trans A2B2 Porphyrins: Synthesis, Crystal Structure Determinations and Hirshfeld Surface Analysis. ChemistrySelect, 2020, vol. 5, no 24, pp. 7298–7309. https://doi.org/10.1002/slct.202001052

Seyfi S., Alizadeh R., Ganji Masoud D., Amani V. Polymorphism of Palladium(II) Complexes: Crystal Structure Determination, Luminescence Properties, Hirshfeld Surface Analyses and DFT/TD-DFT Studies. ChemistrySelect,2019, vol. 4, no 20, pp. 6209–6218. https://doi.org/10.1002/slct.201900804

Luo Y.-H., Zhang C.-G., Xu B., Sun B.-W. A cocrystal strategy for the precipitation of liquid 2,3-dimethyl pyrazine with hydroxyl substituted benzoic acid and a Hirshfeld surfaces analysis of them. Cryst. Eng. Comm.,2012, vol. 14, no 20, pp. 6860–6868. https://doi.org/10.1039/c2ce25767j

Luo Y.-H., Sun B.-W. An investigation into the substituent effect of halogen atoms on the crystal structures of indole-3-carboxylic acid (ICA). CrystEngComm., 2013, vol. 15, no 37, pp. 7490–7497. https://doi.org/10.1039/c3ce40952j

Gökce H., Sert Y., Alpaslan G., El-Azab A.S., Alanazi M. M., Al-Agamy M.H.M., Abdel-Aziz A.A.-M. Hirshfeld Surface, Molecular Docking Study, Spectroscopic Characterization and NLO Profile of 2-Methoxy-4,6- Diphenylnicotinonitrile // ChemistrySelect, 2014, vol. 33, no 33, pp. 9857–9870. https://doi.org/10.1002/slct.201902391

Ivachtchenko A.V., Mitkin O. D., Kravchenko D. V., Kovalenko S. M., Shishkina S. V., Bunyatyan N. D., Konovalova I. S., Dmitrieva I. G., Ivanov V. V., Langer T. Synthesis, X‑ray crystal structure, Hirshfeld surface analysis, and molecular docking study of novel inhibitor of hepatitis B: methyl 4-fluoro-3-(morpholinosulfonyl)benzo[b]thiophene-2-carboxylate. Heliyon, 2019, vol. 5, no 11, pp. e02738. https://doi.org/10.1016/j.heliyon.2019.e02738

Seifullina I.I., Martsinko E. E., Chebanenko E. A., Pirozhok O. V., Shishkina S. V., D’yakonenko V. V. Structure of bis(citrato)germanates with different types of cations: (Hphen)2[Ge(HCit)2⋅3H2O], [CuCl(phen)2]2[Ge(HCit)2⋅6H2O], where H4Cit is citric acid, phen is 1,10-phenanthroline. J. Struct. Chem., 2017, vol. 58, no 3, pp. 532–538. https://doi.org/10.1134/S0022476617030143

Seifullina I. I., Martsinko E. E., Chebanenko E. A., Afanasenko E. V., Shishkina S. V., D’yakonenko V. V. Complex Formation Products in the GeO2–Tartaric Acid–CuCl2–1,10-Phenanthroline System: Syntheses and Structure. Russ. J. Coord. Chem., 2019, vol. 45, no 7, pp. 496–504. https://doi.org/10.1134/S107032841906006X

Chebanenko E.A., Seifullina I. I., Martsinko E. E., Dyakonenko V. V., Shishkina S. V. Directed Structure Formation in Tetranuclear Xylaratogermanates(IV) with Complex Phenanthroline copper(II) Cations. Russ. J. Inorg. Chem., 2020, vol. 65, no 11, pp. 1703–1711. https://doi.org/10.1134/S0036023620110029

Turner M.J., McKinnon J.J., Wolff S. K., Grimwood D. J., Spackman P. R., Jayatilaka D., Spackman M. A., Crystal Explorer 17. The University of Western Australia, Perth, Australia, 2017. https://hirshfeldsurface.net

##submission.downloads##

Опубліковано

2021-04-13

Номер

Розділ

Статті